В СИЗО-2 при активном сотрудничестве с представителями Русской православной церкви проводятся мероприятия с подозреваемыми, обвиняемыми и осужденными, направленные на разъяснения основ традиционных для России религий, формирование толерантного отношения к представителям различных вероисповеданий. На постоянной основе в учреждении организовывается проведение религиозных обрядов и таинств исповеди, крещения и другие.
Особое внимание в беседах с подозреваемыми, обвиняемыми и осужденными уделяется разъяснению преступной сущности терроризма и экстремизма, запрещенного движения «АУЕ», а также профилактике аутоагрессивного поведения лиц, оказавшихся в сложной жизненной ситуации, находящиеся на стадии адаптации к новым условиям в следственном изоляторе.